Расформирование

5 февраля 2010 года акционерами команды было объявлено об отказе от участия в чемпионате России 2010 года. В качестве официальной причины данного шага называлось нежелание основного акционера клуба — концерна «Норильский никель» — содержать непрофильный актив, однако категорический отказ «Норникеля» продать клуб потенциальным инвесторам дал основания некоторым болельщикам предполагать, что снятие «Москвы» с чемпионата обусловлено некими политическими причинами. 11 февраля клуб в лице нового своего руководителя Владислава Плотникова уведомил РФПЛ о снятии с чемпионата сезона 2010 года. 16 февраля РФПЛ официально заявила о прекращении членства ФК «Москва» в Премьер-лиге. 19 марта 2010 было сообщено, что команда будет участвовать в любительском первенстве страны. 23 апреля 2010 команда провела свой первый матч в сезоне 2010 года — в Кубке Москвы против команды Ветеринарной академии, одержав победу со счётом 4:0. В сезоне 2010 команда заняла 3 место в Дивизионе «А» «МРО «Центр», дошла до финала Кубка ЛФК Москвы.

Статистика

Своё первое участие в еврокубках «Москва» начала со встречи с минским «МТЗ-РИПО» 1 июля в рамках Кубка Интертото 2006, которую успешно выиграла со счётом 2:0. Ответный матч, состоявшийся 9 июля на поле соперника, клуб также провёл уверенно и выиграл 1:0. В последнем раунде турнира «горожане» встречались с немецким клубом «Герта», в Берлине была зафиксирована нулевая ничья, а в московском матче гости смогли выиграть 2:0 и лишили ФК «Москва» возможности участия в розыгрыше Кубка УЕФА.

Вторую в своей истории еврокубковую кампанию «Москва» начала в Кубке УЕФА 2008/09, благодаря победе московского ЦСКА в Кубке России 2007/08. В отборочном туре «горожане» одержали победу над польской «Легией» (2:1 в гостях и 2:0 дома). В 3-м раунде по сумме двух встреч «горожан» выбил из турнира датский «Копенгаген» (1:2 дома и 1:1 в гостях).

Достижения                                           

• Лучший результат в чемпионате России: 4-е место — 2007 (тренер —Леонид Слуцкий)
• Финалист Кубка России: 2006/07